Les limites d’utilisation dépendent du principe de fonctionnement.

Dans une pipette à coussin d’air, l’air entre le piston et l’échantillon peut se dilater ou se contracter sous l’effet de changements de température, d’hygrométrie ou de l’échantillon à prélever (liquides volatils, visqueux, denses par exemple). Ces pipettes sont à réserver pour les solutions aqueuses à des températures proches de la température ambiante.

Une pipette à déplacement positif n’est pas affectée par les caractéristiques de l’échantillon et est donc adaptée aux liquides « problématiques », en particulier les huiles, sirops, peintures, aliments liquéfiés.